根据《绿色工厂评价通则》，绿色工厂是实现了用地集约化、原料无害化、生产洁净化、废物资源化、能源低碳化的工厂。
根据《零碳工厂评价规范》，零碳工厂是温室气体排放核算边界内，在一定时间内（通常以年度为单位）生产、服务过程中产生的温室气体排放量，按照二氧化碳当量（CO2e）计算，在尽可能自主减排的基础上，剩余排放量实现由核算边界外的减排项目清除，和（或）相应数量的碳信用抵消的工厂。除了二者在概念上的区别，在评价标准和评定结果上也有所不同：
评价标准：
零碳工厂是由中国节能协会主导，依据的标准是《零碳工厂评价规范》；
绿色工厂是由国家、省、市各工信部门去主导评定，依据的标准是《绿色工厂评价通则》以及2023年7月更新的绿色工厂评价行业标准。
评定结果：
零碳工厂主要划分有Ⅰ型、Ⅱ型两个类型，对应等级为三星、四星、五星、六星。Ⅰ型零碳工厂的要求是100%采用可再生能源电力，以及实现100%抵消；Ⅱ型零碳工厂的要求则是100%采用可再生能源电力，以及实现100%清除；
绿色工厂分为国家级、省级和市级三个层次，国家级申报评选全流程是由工信部发文申报，由各级工信部门逐级上报，最终工信部进行评定。
零碳工厂是以绿色工厂的建设为基础的，是绿色工厂的更高等级。
随着近年“零碳工厂标准”等越来越多的标准出台，将为工厂在减碳目标设定、低碳项目改造、新建项目规划等方面提供明确的依据和路径指导。国内主流“零碳工厂评价”的认定标准为PAS2060:2014/IS014064-1:2018，国内目前制定的评价指南和规范只有团体标准，现有中国节能协会发布的《零碳工厂评价规范》、上海市节能环保服务业协会发布的《零碳工厂创建与评价技术规范》、天津市环境科学学会发布的《零碳工厂认定和评价指南》 、《零碳工厂创建与基于区块链的评价规范》、中国电子节能技术协会发布的《零碳工厂评价通用规范》、中国投资协会发布的《零碳工厂评价标准》。其中，最为严格的是《零碳工厂认定和评价指南》，将“零碳工厂”和相关概念区分开来，“核算期内工厂直接与间接使用的绿色电力及通过CCUS产生的碳减排量占工厂直接与间接碳排放量的比重超过95%(含)但小于100%的的工厂”是“近零碳工厂”，“核算期内工厂直接与间接使用的绿色电力及通过CCUS产生的碳减排量占工厂直接与间接碳排放量的比重超过85%但小于95%的的工厂”是“超低碳工厂”，且这三种认证每三年进行一次复评。